Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlgn1Q99K10 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nlgn1Q99K10 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms