Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
SptssbQ925E8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms