Protein–RNA interactions for Protein: Q920B0

Frmd4b, FERM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4bQ920B0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmd4bQ920B0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms