Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms