Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cabp4Q8VHC5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms