Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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