Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmx1Q8VBT0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms