Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxc12Q8K5B8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxc12Q8K5B8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxc12Q8K5B8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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