Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lin28aQ8K3Y3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lin28aQ8K3Y3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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