Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrtm1Q8K377 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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