Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssh3Q8K330 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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