Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms