Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8K039 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8K039 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q8K039 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8K039 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8K039 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8K039 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8K039 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8K039 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms