Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trpm6Q8CIR4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trpm6Q8CIR4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trpm6Q8CIR4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm6Q8CIR4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm6Q8CIR4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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