Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Gm9955Q8CEJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm9955Q8CEJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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