Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ephb1Q8CBF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms