Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc159Q8C963 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms