Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apol9bQ8C7I4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9bQ8C7I4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms