Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ccdc113Q8C5T8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc113Q8C5T8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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