Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FarsaQ8C0C7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms