Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Iffo1Q8BXL9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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