Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctdsp2Q8BX07 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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