Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pggt1bQ8BUY9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pggt1bQ8BUY9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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