Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubr7Q8BU04 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubr7Q8BU04 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms