Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl16Q8BSU2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cxcl16Q8BSU2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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