Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3Q8BRE0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3Q8BRE0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3Q8BRE0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3Q8BRE0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rd3Q8BRE0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms