Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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