Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdca8Q8BHX3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms