Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn3Q8BHH8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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