Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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