Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW7

Lpp, Lipoma-preferred partner homolog, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LppQ8BFW7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LppQ8BFW7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms