Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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