Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc29Q80VM3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc29Q80VM3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc29Q80VM3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc29Q80VM3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc29Q80VM3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc29Q80VM3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ttc29Q80VM3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ttc29Q80VM3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ttc29Q80VM3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttc29Q80VM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms