Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sestd1Q80UK0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sestd1Q80UK0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms