Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja2Q80U04 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms