Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6aQ78XR0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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