Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.2 ms