Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scaf4Q6PFF0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms