Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms