Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zbtb40Q6PCS8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zbtb40Q6PCS8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms