Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atl2Q6PA06 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms