Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms