Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdhbQ6P3A8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhbQ6P3A8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms