Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms