Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atg16l2Q6KAU8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms