Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt40Q6IFX3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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