Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdc5lQ6A068 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdc5lQ6A068 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms