Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170Q6A065 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170Q6A065 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms