Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnna3Q65CL1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnna3Q65CL1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms