Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms